En 1868 se desplazó a Valladolid con la familia Sabater, donde servía. En la Iglesia del Rosarillo, conoció al P. Miguel San José Herranz, SJ y fue entonces cuando pensó en fundar una “Congregación con el nombre de Hijas de Jesús”, para dedicarse a la salvación de las almas por medio de la educación e instrucción de la niñez y juventud.
El 8 de Diciembre de 1871 en Salamanca y junto a otras cinco mujeres, dio inicio a la Congregación con la Misa celebrada en la Iglesia de la Clerecía.
Con 26 años y con la ayuda del P. Herranz, Juana Josefa comenzó a formar a las aspirantes del nuevo Instituto poniendo a su alcance el Sumario de las Constituciones ignacianas y en poco tiempo la congregación se expandió creando instituciones por toda España.
En 1911 las Hijas de Jesús abren varias casas en Brasil, primer paso de su expansión internacional.
Murió el 9 de Agosto de 1912. El 12 de Mayo de 1996 fue beatificada por el Papa Juan Pablo II y el 17 de Octubre de 2010 canonizada por Benedicto XVI.